什么可影响疫苗效果？
首先，是疫苗本身的问题。因生产厂家不同，有的疫苗达不到有效浓度；有的疫苗稳定性差，在运输、储存过程中由于冻结或高温而失效；有的疫苗抗原成分不全，例如猪瘟疫苗，只有分离株而没有兔化弱毒苗；部分疫苗免疫原性差，免疫效果不高。
其次，是免疫接种过程中的问题。如注射剂量不够，免疫途径错误；同时注射几种疫苗，发生免疫拮抗作用，而影响免疫效果；注射器械重复使用而感染传播疾病；使用了未经冷灭活的疫苗，导致传染疾病发生等。
第三，是畜禽本身的问题。如在免疫接种前，该畜禽已感染上该种疾病，但由于潜伏期长，而无临床症状，以致免疫后发病；按照常规免疫程序免疫预防某种传染病，但该种疾病的传播因子在该地特别大量存在，如高致病性猪繁殖与呼吸综合征HCV在某些地区大量存在时，按常规免疫程序接种猪繁殖与呼吸综合征弱毒苗，仍无法防止该病的发生；按照常规免疫程序进行免疫，但因免疫时间已超过该动物对该疫苗的免疫应答时期，以致发生该种疫病；有些动物对该疫苗缺乏免疫力，特别是副泥腺结实症，有30%的猪对该苗缺乏免疫力。
第四，外界环境的影响。如按规定程序注射口蹄疫疫苗，但个别猪仍发生口蹄疫，有可能是应南方气候的影响，产生变异毒株，导致疫苗产生的抗体无效。